自力で出来るところまでやってみてから、外部コンサルの支援を仰いではどうでしょうか。
まずは、業務の流れを図式化(ワークフロー)することをお勧めします。「業務フロー図の上手な書き方」を参考にしてください。
目的は、
といった点を洗い出すことにあります。
量やコスト/時間が多くかかっている作業に対しては、システムの導入や外注化ということが考えられます。
ここまで整理できていれば、外部コンサルに相談する際にも話がスムーズに進みますし(過去質問「ECサイト運営のコンサルタントで、おすすめの先生(or企業)を教えて下さい」参照)、ご自身でパッケージソフトの選定ができるかもしれません。
規模がわからないのでなんとも言えないですが、まずはECの多店舗を一括して管理するパッケージを検討されるのがよいかと思います。
下記はデモ等を利用したことがありますが、おすすめできます。
SAVAWAY
next-engine
特攻店長(名前がすごい。。)
頑張れ店長(http://www.ganbare-tencho.com/)というソフトは
楽天やyahooに出店されている中規模以上の店舗では多く使われているようです
私の知り合いのところでも使っています。
初期費用などがかかると思いますが、非常に便利なように思います。
csv等で売り上げデータが吸い出せたと思うので、
FileMakerやAccessなどを使って処理ソフトをつくることが出来ると思います
(前述の頑張れ店長はFileMakerだったとおもいます)
ご丁寧な説明、誠にありがとうございます。
さしあたりご指摘のあった通り実践してみたいと思います。