使用しているメールクライアント(ソフト)が分からないと、よい回答が得られないと思います。。。
たとえば、新規にメールアドレスを取得するのであれば、フリーのGmailを使ってみてはいかがでしょうか?
検索やフィルタ機能で、自由にカスタマイズできますよ。
Windowsに搭載されている、Outlookを使っているのであれば、次のようなプラグインを使用してみてはいかがでしょうか。
http://www.ariel-networks.com/blogs/tokuriki/cat36/cat37/xobni.h...
http://www.rimarts.co.jp/becky-j.htm
Beckyというメールソフトなら通常はメールのやり取りでメールをツリー状にまとめて表示できますがスレッドツールという機能があってそれを使うとそのツリーに別の加えたり切り離したりできます。
xobniの人ごとにメール、添付ファイルの表示...というのをoutlook, Thunderbirdでしたいということです