ウイルスソフトのタスクバーのアイコンをクリックしようと思ったところ、そのアイコンが消えました。再起動をして、クリックできたのでその時は気にならなかったのですが、

ノートンインターネットセキュリティ2008を使ってます。
不思議なのですが最新のノートンはWindows2000に対応していません。
無理に動かしているのでしょうか?
それとは古いバージョンのノートンでしょうか?
.
最新版を2000で動かしているでしたら動作不良を起こしても苦情が言えません。
止めた方がいいと思います。
古いバージョンのノートンを使っているのでしたら
対応できないウイルスが出てきているかも知れ万ので最新の物にした方がいいのでは?
.
OSをXP以上にするか、2000対応のセキュリティソフトにするかだと思います。
私の家の2000のマシンは、このソフトのJ:COM版が入っているはずです。
http://www.ahnlab.co.jp/product/v3vbis2009p.asp

既に何らかの理由によりウイルス対策ソフトが終了している状態だったのではないでしょうか？
ソフトを強制終了したりすると、まれにタスクトレイにアイコンが残っている場合がありますが、カーソルを載せると消えます。

Windows2000ということですが、対策ソフトの動作環境に含まれているでしょうか？
2000は動作対象外というソフトが増えているようですが・・・

動作環境に問題がない場合は、オンラインで検索してみてはいかがでしょう？

http://www.trendflexsecurity.jp/security_solutions/housecall_free_scan.php
※トレンドマイクロのオンラインスキャンは2000も対象のようです。

確かにWindows2000には対応しないソフトが増えましたが
ノートンについては今でも旧ＯＳにも対応したバージョンの販売と延長サポートを行っています。
http://www.symantecstore.jp/Contents/norton2005/2005dl.asp

Windows2000のタスクトレイはXPの通知領域のように折りたためるような機能はありませんので
消えるとすればノートンもしくはエクスプローラでトラブルが発生したという事ですが
私には、何が原因かの特定までは行えません。お力になれず申し訳ないです。

お返事が遅くなりましてすみません。
ノートンは、月額タイプの以下の2000対応のインターネットセキュリティーを利用しております
http://www.symantec.com/ja/jp/norton/theme.jsp?themeid=sos&footer=2

ｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉ絵ｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉ画ｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉ絵ｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉ画絵ｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉ画ｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉ絵ｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉ絵ｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉ画ｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉ絵ｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉ画ｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉ絵ｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉ絵ｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉ絵ｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉ画絵ｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉ画ｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉ絵ｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉ絵ｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟﾉ)ﾉｴｰｯｯ!！Σ(ﾟロﾟ