全国の中高一貫に通う生徒数（高等部在籍者のみで中等部を含まないものがベスト）が分かるデータを教えてください。

お役所の数字ではなさそうですね。

http://www.mext.go.jp/b_menu/shingi/chousa/shougai/020/021_1/gij...

『学校基本調査』を例にすれば、個票データを年度ごとに保管している。

　報告書として公表している以外の集計を行いたい場合は、省内からの依頼であっても目的外利用の申請を行ってもらい、提供している。データベース化されていて省内で自由に使用できるような仕組みにはしていない。

そして、公表している統計表の一覧は下記の通りで、ご質問の通りありません。

http://www.e-stat.go.jp/SG1/estat/List.do?bid=000001015815&cycod...

まずは、利用目的を伝えて文科省に電話するのがいいのではないでしょうか。

念のため調べてみましたが、四谷大塚も日能研もデータを公開していませんでした。

http://www.yotsuyaotsuka.com/njc/link/l_index.html

後は下記のような本を購入して地道に足し算するとか、著者に尋ねるとか。

中学受験 公立中高一貫校のすべて―全国96校の傾向と対策

• 作者: 若泉 敏 高清水 美音子
• 出版社/メーカー: ダイヤモンド社
• メディア: 単行本

ニッチなマーケティングデータはたやすくは得られない、ということでしょうか。