iphone で利用する、Google のナビゲーション　アプリは、

これはできませんね。
iPhoneのアプリが起動できるのはiPhone上か、iPhoneSDKに付属してくるシミュレータ上だけです。
iPhone以外のデバイスで起動するとなると、Macのノートでシミュレータを使うことになりますが、
シミュレータはGPSに必要なCoreLocationライブラリをサポートしていません。

iPhoneのアプリが使いたいのではなく

パソコン(ノートパソコン)の上で使うGogle Mapsのルート検索の
出発のデータに自動的にPCにつけたGPSの位置データを利用できないかというのでは？
[google map gps 連動]で検索するとたくさんGPS連動の手法が出てくる。
というのは逆に簡単にはリンクできないということだと思います。

これはMAPを表示するだけだと思いますが
>GPSデータをGoogle Maps/Earthで可視化する
http://bg66.soc.i.kyoto-u.ac.jp/forestgps/gpsdiary/archives/2008/05/gpsgoogle_mapsearth.html

その他のGoogle Mapsの使い方の説明はここが使いやすそうに思います。
>Google Maps（グーグルマップ）の使い方まとめ（地図）
http://google-mania.net/webservice/googlemap

なるほど、iPhoneアプリに拘るわけではないのですね。
しかし、Earthではできますが、Mapsはモバイル版以外ではあまり聞いたことがないのでちょっと分かりません。
Earthなら有料ですがPro版でできますが・・・。
http://earth.google.com/support/bin/answer.py?hl=jp&answer=148095

お力になれずすみません。
良い回答が付くと良いですね。