車の免許がAT限定の人が、MT二輪の免許を取るのはハードルが高いですか？

sebleさんの言うように別物ですよ。
MT車の免許持った人でも同じでハンディなし
スクーターでも乗ったことあれば
小型二輪くらいならハードル低いです。

　私は以前、単純なスクーターを暴走させて顰蹙を買った事があります。
少しアクセルを上げただけで前輪が持ち上がるほどのバランスの悪い機体とは思わなかった。
その分スピードが出るんだなと納得した事がある。
　
　当時でも４ｔトラックまでならクラッチ付きで普通に乗ってたんですけどね。
カブのクラッチは慣れるまでがたいへんでした。
理屈では分かってるんですが、実物はタッチからして別物でした。
運動神経とセンスの問題だと思うけど、免許取得の場合は法令遵守が第一目的なんだから、真面目なら問題無いと思う。

ばかにする訳ではないですが、もし、4輪でMTを取るのが全く不可能、ミッションって何？というほどだと2輪も同様に厳しいかもしれません。
昔は誰かしらミッション付き原付を持っているのが当たり前で、借りてちょっと試してみるなんて事もできたんですけどね。
最初からうまく乗れはしないですが、ちょっと触ってみるのがいいですよ。

id:yuki1123さん
誰も指摘しないし、分かっていないようだから書きますが、ここは回答を開くだけで20ポイント必要とします。
コピペ回答なんてとんでもないし、つまらない事も書くべきではないです。
それにあなたのリンクはおかしい場合が多い。
（ハツヤスミって何よ？natuyasumiだろ？）
今回もそのままでは出ません。
http://aic.driver.co.jp/campaign/natuyasumi.html
修正したら出はしましたけどね。
でも、このサイトのどこに2輪MTの難易度が書いてあります？
あなたが問い合わせてみた事があるんですか？
恐らく、はっきりした答えは得られないと思いますよ。
それに問い合わせろ、というのでは答えになっていません。
学校のテストで○○大学の電話番号を書いて、「ここに聞いてください」
て回答入れますか？
ま、一部では受けるだろうけど、点数は付かないですね。
高校でそんな事をやっていれば進級できません、いわゆるダブリってやつ。
たぶん、あなたは13才未満かかろうじて超えている程度なのだろうと思いますが、こっちは一応大人のサイト。
金もからんでいるし、真面目にやらないと叩かれますよ。
（ま、俺も叩かれてるけどね、ｗ）

＞少しアクセルを上げただけで前輪が持ち上がるほどの
絶対チューンされてますね、ｗ
カブはカブでまた別で、あれも扱いが難しいですね。
カブのミッションだけは好きになれない。

＞絶対チューンされてますね
チューンしなくてもなります
Vベルト駆動の奴はトルクが増幅されてるから。

バイクにもAT限定(AT小型２輪限定、AT普通２輪限定,AT大型２輪限定)があるので、そちらに挑戦してみるのもいいかもしれませんね。
MTよりずっと楽です。