mysql4.1.13を利用しております。リモート接続処理が重い原因を知りたいです。

WEBサーバーからDBサーバーにローカルでmysql接続し、ある検索をかけると
「Writing to net」というステータスが表示され、かなり時間がかかります。
直接DBにログインし同じ処理を行うと問題なく処理できます。


最初名前解決かな？と思い、逆引きの設定を見てみましたが正常に名前解決できておりました。
また、「skip-name-resolve」を設定してもダメでした。（もちろん権限はIPアドレスで指定してます）

同ネットワークの別サーバーから接続しても結果は同じです。

ただし、別ネットワークのサーバーからグローバルでmysql接続した場合はちゃんと処理できます。
それならとWEBサーバーからDBサーバーをグローバルで接続しましたが、それはダメでした。

HUB、LANケーブル、ネットワークカードは交換してみましたが、解決しておりません。

初心者で、文面が分かりづらいとは思いますが宜しくお願いします。