夫婦でマンションのローンを分担して借りています。ローンの借り換えを機に債務を私に一本化しようと考えていますが、その際贈与税がかかると聞きました。仮に妻のローン残高を1000万円とした場合、贈与税はいくら位かかるものなのでしょうか？

　ご質問によると、ローンの借り換えということになると思いますので、ご質問者の借り入れで奥さんの債務を支払ったことになると思います。
　仮に1000万円の債務をご質問者が引き受けたとすると、ご質問者からの1000万円の贈与になると思います。
http://www.nta.go.jp/taxanswer/zoyo/4408.htm
　↑によると税率40%ですから、結構取られるのではないでしょうか。
　
　ですが、奥さんのマンションの持分があるので、それをご質問者に贈与すれば相殺できるはずです。贈与というより交換ですね。
　ただしこれには不動産取得税と、登記をするなら登録免許税がかかると思います。贈与税よりははるかにマシだと思いますが。