英語で書かれたPDFファイルの日本語翻訳をするソフトはありませんか

翻訳ソフトは普通にそういう機能があると思いますが。
しかし、そのPDFがAPIによる読み出しを禁じる保存が行なわれているとだめですよ。
>ATLAS
http://software.fujitsu.com/jp/atlas/function/
#連携翻訳 (Word, Excel, PowerPoint, Acrobat)
Word、Excel、PowerPoint上の翻訳ボタンを追加（アドイン）することができます。 文書を開き、翻訳ボタンをクリックするだけで、レイアウトを保持したまま文書を翻訳することができます。

>【ＡＴＬＡＳ】PDF ファイルを翻訳する
http://www.fmw.co.jp/demo/downloads/atlas_pdf.pdf