質問です！うご3dは長く(3年間は)続くと思いますか？また、3dソフトでお勧めがあれば教えて下さい!さっきからいろいろすいません…

私は、よほどの不祥事がない限りは続くと思います。ですが、今の状態じゃ盛り上がりは少ないままですね。
おすすめソフトとしては、あなたがボーカロイド好きだったら、かなり先(１１月２８日)の発売になってしまいますが、「初音ミク　Project　mirai　２」
だったりありますね。

やはり今回の運営はNintendoということもあってすぐに終わることもないでしょう。
今回使用者からお金を取る理由は、長く運営しているとサーバー管理などでランニングコストがどうしてもかかってしまいます。
それの埋め合わせでしょう。

おすすめのソフトですが「リズム怪盗R」ですね。
３DSの中のソフトであまり流行らなかったが隠れた名作 のような位置づけだと私は思っています。
キャラやストーリーがしっかりとしていて難易度も程よいところがイイですね。
発売当初のソフトなので今は安く手に入ると思います。

３ＤＳの次世代機がでてしばらくしたらだと思います

そもそもDSi版のうごメモはなぜ長続きしなかったのかと言うと、
多分DSiの次世代機の3DSと互換性がなかった事が一番大きいでしょう。
また、運営が任天堂ではなくはてなだった事で、
そのまま3DS版に引き継ぐことが難しかったのだと思います。

とすると、3DSの次世代機が3DSとどれだけ互換性を保てるかですね。
あるいは互換性があっても、あまりに過疎化したりユーザのマナーが悪ければ、
引き継いだりしてくれない可能性もあります。
運営は任天堂なので、後者の問題は克服しています。

お勧めのソフト？
3Dのソフト一本しか持ってないんで何とも言いようが…
「洞窟物語3D」ってソフトなんですけど、
これは洞窟物語っていうPCの人気のフリーゲームを移植した物で、
無理矢理3Dの要素を付け足した感じで、正直あまり良いとは言えません。
原作はもう比べようがない神ゲーなんですけどね。
残念ながらそっちはパソコンのゲームです。