行政手続法5条に登場する「審査基準」が何故講学上「行政規則」に分類されるのか、スッキリしません。基準設定と公表が必須であり国民の権利義務に直接関係ありそうなことですから、「執行命令」に分類されたほうがスッキリすると思うのですがいかがでしょう？（告示、通達、訓令については行政内向けの「行政規則」として理解できますが）。

通達にパブコメが必要かというと、通達という形で審査基準等を定めていることがあるので、その場合は必要ということになります。「通達　審査基準」等で検索してみましょう。

こちら、通達ですが、「行政手続法に基づく手続」となっています。命令等と言えるのかという問題はありますが。そこに載っている意見は私が出したんですけどね。

https://public-comment.e-gov.go.jp/servlet/Public?CLASSNAME=PCM1...

こちらも通達ですが、「行政手続法に基づく手続」となっています。こちらは結果的に私人に権利義務を定める意味合いが強いので、意見が殺到して改められました。

https://public-comment.e-gov.go.jp/servlet/Public?CLASSNAME=PCM1...

確かに審査基準は結果的に私人に権利義務を定めますが、直接には行政の内部ルールだから行政規則です。

刑務官の職務執行に関する訓令

https://www.moj.go.jp/content/001321779.pdf

にしたって結果的に受刑者の権利義務を定めてはいますが、直接にはあくまで刑務官の権利義務を定めているので行政規則です。

執行命令でも行政規則でもあり得るというのは、解釈によって見解が分かれるというのはあるのかもしれませんが。

航空学生たる自衛官の任用等に関する訓令の一部を改正する訓令案に関する意見の募集

https://public-comment.e-gov.go.jp/servlet/Public?CLASSNAME=PCMM...

が現在されていますが、これも結果的に志願者の権利義務を定めてはいますが、直接にはあくまで自衛官を採用する側の権利義務を定めているので行政規則です。