翻訳ｿﾌﾄは普通にそういう機能があると思いますが｡
しかし､そのPDFがAPIによる読み出しを禁じる保存が行なわれているとだめですよ｡
>ATLAS
http://software.fujitsu.com/jp/atlas/function/
#連携翻訳 (Word, Excel, PowerPoint, Acrobat)
Word､Excel､PowerPoint上の翻訳ﾎﾞﾀﾝを追加(ｱﾄﾞｲﾝ)することができます｡ 文書を開き､翻訳ﾎﾞﾀﾝをｸﾘｯｸするだけで､ﾚｲｱｳﾄを保持したまま文書を翻訳することができます｡

>【ATLAS】PDF ﾌｧｲﾙを翻訳する
http://www.fmw.co.jp/demo/downloads/atlas_pdf.pdf