ER Masterはどうでしょうか
ER図を作成するためのEclipseプラグインのようです。
質問に使用しているDBが記述されていないので、使えるか分かりませんが
リバースエンジニアリングすることも可能みたいです。
高機能ERモデリングツール「ER Master」でデータベース設計!
http://journal.mycom.co.jp/column/ide/073/index.html
ERMaster
http://sourceforge.net/projects/ermaster/
ユーザーマニュアル
構造の取得方法はデータベースによって大きく違う
技術的質問は必ず環境を書くこと
これまでの質問履歴から勝手にMySQLだと推測
DBDesigner
本家
http://fabforce.net/dbdesigner4/
レビュー
http://blog.8maki.jp/2007/01/dbdesigner.html
日本語化サイト
MySQL Workbench(MySQLの開発元からの供給だが情報はまだ少なく次点)
>DBDesignerはリバースエンジニアリングの機能を持っていません。
真偽は回答2のレビュー先を見ればわかる
回答2のレビュー先に
「MovableTypeのテーブル構成ではまったく関連を検地(ママ)できなかった」
と書いてありますがwww