IETF(アイイーティーエフ;Internet Research Task Force)という組織がご質問の内容を受け持っています。IETF(英語)http://www.ietf.org/標準化されたプロトコルはRFC という規格として発表されます。日本語訳もありますので、参考にされたらよいかと思います。"RFC日本語版リスト"http://www5d.biglobe.ne.jp/~stssk/rfcjlist.html
RTFが6000番近くまであるのに驚きました。よくもこれだけたくさんのプロトコルを管理していますねェ。RTF相互の関係を理解する対照表のようなものはありますか? たとえば、XXXX番のRTFはXVXX, XVVII番と前後関係にあるとか、そういうものを一覧できないでしょうか。 こんなにたくさんあるプロトコルを統一的に理解するのは、大変ですね ありがとうございました。
RFCそれぞれがどのレイヤに属するのかってのは、どうすればわかりますでしょうか
一覧は見たことがありませんが、たいていの場合本文に「このRFC に関連して○○はxxx番、△△はxxxx番で規定されている」とか「このRFCはxxxx番とxxxxxxx番を統合する」といった記述があります。また、どのレイヤかというのも本文を読めば分かるようになっています。逆に言うと、本文を読んでも分からないレベルであればひとまず CCNA などの資格を勉強された方がよいかと思います。ご指摘のとおり膨大な体系ですから「これを読んだらOK」「これでひととおり理解出来る」というものはありません。
IETFによるTCP/IPに関するRFCは規格でなく標準、さらに全てが標準というわけではないと。
IETFはメーリングリストに参加すれば誰でも議論に加われるようなので、トライされてみては?