http://q.hatena.ne.jp/1510418553

ブックマークツールバーのフォルダの favicon は、userChrome.css という仕組みで変更できます。
https://developer.mozilla.org/ja/docs/Mozilla/Tech/XUL/Tutorial/Modifying_the_Default_Skin

多分、プロファイルディレクトリには、chrome というディレクトリはないでしょうから、

1. 新規に chrome という名前のディレクトリを作成する
2. chrome ディレクトリに、userChrome.css という名前のテキストファイルを作成する

という手順を踏みます。

変更したい favicon の画像を Data URI Scheme します。
変更したいブックマークのフォルダにユニークな名前をつけておきます。
userChrome.css に以下の内容を書き込んで、文字コードを UTF-8 で保存してください。

ブックマークツールバーの favicon を変更する場合には、以下のように書きます。

toolbarbutton.bookmark-item[label="フォルダ名"] > .toolbarbutton-icon {
    list-style-image: url(data:image/png;base64,iVBORw...) !important;
}

一行目の label="..." は、そのフォルダにつけた名前です。
二行目の url(...) は、画像の Data URI Scheme です。

ブックマークツールバーのサブフォルダの favicon を変更する場合には、以下のように書きます。

menu.bookmark-item[label="フォルダ名"] .menu-iconic-icon {
    list-style-image: url(data:image/png;base64,iVBORw...) !important;
}

全てのフォルダの画像を、同じ favicon に変更する場合には、以下のように書きます。

.bookmark-item[container] {
    list-style-image: url(data:image/png;base64,iVBORw...) !important;
}