お店で売ってるiPadがiOS5になっているかはわかりませんが、初代・二代目ともにiOS5対応です。
出荷状態という意味であれば,iOS 4系列が入っているはずですので,ユーザーサイドでiOS 5をインストールする必要があると思います.(Apple Storeなんかで展示されてるiPad 2にはiOS 5が入っていますが,あれはお店の人が入れたんでしょうね…)