返信遅れました久根です｡
方法としてはいくつかありますが､場合によってはどれも効率的ではない可能性があります｡

【方法】
1､Aさんのﾌｫﾛﾜｰ数を調べる
2､Bさんのﾌｫﾛｰ数を調べる
3､Twitmgrというｻｲﾄで調べる
3番については使った事がないので､何とも言えません｡

この三つが僕の知っているものです｡
上記にもありますが､場合によっては､ひたすら探す可能性もあります｡例えば､Bさんがﾌｫﾛｰを許可していなくてﾂｲｰﾄが非公開にされているときとかは2番目は使えませんね｡

質問がありましたら､Twitterやｺﾒﾝﾄなどでお知らせ下さい｡

DoesFollowというｻｰﾋﾞｽがあり､Twitterのﾌｫﾛｰ関係を調べることができます｡
DoesFollow - doesfollow.com - Find out who follows whom on Twitter

例えば､はてなの近藤社長(jkondo)が大阪維新の会の橋下徹氏(t_ishin)をﾌｫﾛｰしているかどうかを調べてみると､｢yup｣となりﾌｫﾛｰしていることが判ります｡
http://www.doesfollow.com/jkondo/t_ishin

逆に橋下氏が近藤社長をﾌｫﾛｰしているかどうかを見てみると､｢nope｣となりﾌｫﾛｰしていないことが判ります｡
http://www.doesfollow.com/t_ishin/jkondo

とまあこんな感じです｡

ID1さんがID2さんをﾌｫﾛｰしているかをﾁｪｯｸするには
http://www.doesfollow.com/X/Y
に以下を代入したものをﾌﾞﾗｳｻﾞｰのｱﾄﾞﾚｽへｺﾋﾟﾍﾟすればよいということですね
X＝ID1
Y＝ID2

具体例
X＝uesugitakashi 上杉隆 / Takashi Uesugi
Y＝amneris84 Shoko Egawa
で
http://www.doesfollow.com/uesugitakashi/amneris84
yup

X＝amneris84
Y＝uesugitakashi
で
http://www.doesfollow.com/amneris84/uesugitakashi
yup