javascriptの質問です http://jsfiddle.net/cw47p4um/6/ こちらのﾍﾟｰｼﾞなのですが回答の行にﾏｰｶｰを引く仕組みにしていますなぜか一問目のjavascriptが上手く動かず…

最初のようになっていないからでしょう｡

少し変えてみました｡

<body><table>
 
 <td>14<input type="checkbox" class="hikakubox"> </td>
 
 <td>48</td>
 <td>赤いのはどれか<BR><input type="checkbox">a りんご<BR><input type="checkbox">b みかん<BR><input type="checkbox">c たいや<BR><input type="checkbox">d なし<BR><input type="checkbox">e 黒</td><td>a</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>14<input type="checkbox" class="hikakubox"></td><td>49</td><td>黄色はどれか<BR><input type="checkbox">a ばなな<BR><input type="checkbox">b みかん<BR><input type="checkbox">c 銀色<BR><input type="checkbox">d みかん<BR><input type="checkbox">e 黒</td><td></td><td></td><td>a</td><td></td></tr>
</table></body>

二つ目のに合わせる場合､ﾀｸﾞを調整しないとﾀﾞﾒでしょうね｡

一連の質問を考慮して､ちょっと書き直しました｡
http://jsfiddle.net/b5cgdm3d/1/

考慮したのは､こんなところです｡

回答に､ﾁｪｯｸﾎﾞｯｸｽが付いて､LABEL で括られることがある
ﾎﾞﾀﾝを押して､回答に色を付けたい

window.onload = function() {
 mark_answer();
}

function mark_answer() {
 var trs = document.getElementsByTagName("tr");
 for (var i = 0 ; i < trs.length ; ++i) {
 var ans = trs[i].children.item(5);
 re_ans = new RegExp("^[" + ans.innerHTML + "]");
 var ele_q = trs[i].children.item(2);
 walk_and_mark_answer(ele_q, re_ans);
 }
}

function walk_and_mark_answer(node, re) {
 var ele = node.firstChild;
 if (! ele) return;
 do {
 if (ele.nodeType == 3) {
 if (re_ans.exec(ele.nodeValue)) {
 var wrap = document.createElement("span")
 wrap.className = "answer_marker"; // ★目印
 ele.parentNode.insertBefore(wrap, ele);
 wrap.appendChild(ele);
 ele = wrap;
 }
 } else if (ele.nodeType == 1) {
 walk_and_mark_answer(ele, re);
 }
 } while (ele = ele.nextSibling);
}

ﾎﾞﾀﾝを押して回答に色を付けたい場合には､関数 mark_answer() を､ﾎﾞﾀﾝの click で呼び出してください｡

因みに､http://jsfiddle.net/cw47p4um/12/ が､期待通りに動かなかった理由｡

 var ans = trs[i].children.item(3);

これは､回答が TABLE の 4列目にあることを想定しています｡
列が増えたので､回答を見失っていたのが､回答の色を付けられなかった､一番の理由です｡

問題文に色が付いてしまっていたのは､色を付けるための目印にしていた変数のｸﾘｱができていなかったためです｡
この回答で書き換えたｺｰﾄﾞでは､LABEL で括られた箇所も見るようにした過程で､色を付けるための目印にしていた変数も使わないように書き換えました｡