独学で情報工学の勉強をしていますが，

臨床工学シリーズ 7

情報工学

はどうでしょう。

http://www.coronasha.co.jp/np/detail.do?goods_id=690

一昔前の教科書ですが、今でも古典です。

「The Art of Computer Programming」

http://ja.wikipedia.org/wiki/The_Art_of_Computer_Programming

rakuten:book:11235286:detail

rakuten:book:11305820:detail

クヌース先生については

http://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%83%89%E3%83%8A%E3%83%AB%E3%83%8...

でも、このような書籍から入るのも実践的かも

わかりやすいディジタル情報理論

• 作者: 塩野 充
• 出版社/メーカー: オーム社
• メディア: 単行本（ソフトカバー）

「メディア論」マーシャル・マクルーハン（みすず書房,198706）

メディア論―人間の拡張の諸相

• 作者: マーシャル マクルーハン
• 出版社/メーカー: みすず書房
• メディア: 単行本

古典的良書といえば、

"Structure and Interpretation of Computer Programs"

http://mitpress.mit.edu/sicp/

C/C++のような手続き型言語はプログラマなら皆知っていますが、lispのような関数型言語は大学で教育を受けた人しか知らないと思います。読むべきです。

Structure and Interpretation of Computer Programs, 2nd Edition (MIT Electrical Engineering and Computer Science)

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Harold Abelson Gerald Jay Sussman
The MIT Press
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"モダン オペレーティング システム"

当時はモダンだったかも知れませんが、もはや古典です。でも読むべきです。

モダン オペレーティング システム 原書 第2版

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Andrew S.Tanenbaum
ピアソン・エデュケーション・ジャパン
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おすすめ度の平均:

TanenbaumといえばMinixだと思っていた
上級者向けの教科書
OSの教科書

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オートマトン言語理論 計算論

最近の本ですが、結構有名です。

オートマトン言語理論 計算論〈1〉 (Information & Computing)

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J. ホップクロフト J. ウルマン R. モトワニ
サイエンス社
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おすすめ度の平均:

有限オートマトンから決定不能性まで
最良の入門書

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個人的にはこちらのページがよくまとまっていると思います。

Leo's Chronicle: ぜひ押さえておきたいコンピューターサイエンスの教科書

コンパイラ―原理・技法・ツール

通称「ドラゴンブック」と呼ばれているこの本は、ＭＩＴの学生や教授にも使われているそうです。

下のＵＲＬは日本語版の書籍です。

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情報のはなし―この本の情報量30万ビット

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人工知能のはなし―AI,ファジィ,ニューロ,ロボット

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システムのはなし―複雑化・多様化へのチャレンジ

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工学部の大学院卒です。

ある程度体系的にまとまった知識が欲しいということですね。自分で勉強をすると、好きなことしかしないので、どうしても漏れを生じてしまいますよね。

こういった人は、とりあえず情報処理技術者試験の勉強をされるとよいかと思います。ソフトウェア開発技術者程度をやるといいと思います。合格のためには普段自分が触れない技術についても知識として勉強をせざるを得なくなりますし、情報工学の骨格的な事項を学ぶ必要がでてきます。

それから自分の好きなことをばんばんやっていかれるとよいのではないでしょうか。書籍についてはコンピュータの名著100にでも出ているのを読んでおけばいいと思います。