｢見出し｣の設定が初期設定の2段表示になっているためだと思われます｡

｢管理｣→｢設定｣→｢記事の設定｣→｢表示ﾓｰﾄﾞの選択｣→｢見出し｣から､

初期設定の｢見出しを2段で表示 (初期設定)｣ではなく､｢見出しを1段で表示｣を選択して下さい｡

初期設定(見出し2段表示)のままでｶﾃｺﾞﾘｰ表記を[?]という形式にしたいのであれば､簡単な方法は見出しの[]の間に入れる大括弧を［］のように全角にする位しかないと思います｡

例えば*[［ｶﾃｺﾞﾘｰ1］][［ｶﾃｺﾞﾘｰ2］] のようにするなどです｡

※半角で重ねてしまうと､はてなﾀﾞｲｱﾘｰでは括弧の部分をｷｰﾜｰﾄﾞ記法と判定してしまうようなので上手く動作しません｡

ただこの方法でもｶﾝﾏ表示は消えません｡(CSSなどを使えばできるかもしれませんが)