1. 中断するには電源を落とすしかなさそうです｡もちろん状況がもっと悪くなる可能性はあります｡
http://okwave.jp/qa/q3527891.html

2. 数時間程度とかは良くあるようですが､既に50時間以上なわけで､正常ではないですね｡
しかし､ﾁｪｯｸﾃﾞｨｽｸ自体が異常時に行うものですし､なくはないようです｡
http://answers.microsoft.com/ja-jp/windows/forum/windows_7-performance/chkdsk%E3%82%92%E6%8E%9B%E3%81%91%E3%81%9F/4e5f3c2b-9e15-49c9-b93d-124a9ac609b6
http://answers.microsoft.com/ja-jp/windows/forum/windows_7-performance/%E3%83%81%E3%82%A7%E3%83%83%E3%82%AF%E3%83%87/7df7fcf5-cb48-e011-8dfc-68b599b31bf5

3. ｢File record segment ****** is unreadable｣ということで､
正常にﾃﾞｰﾀが読めない所が沢山あり､それを何とか読もうと何度もﾘﾄﾗｲを繰り返しているために､処理が遅々として進まないのだと思います｡

色々な可能性がありえますが｢1TBの方は以前から使っていて､SATAに直接さしただけです｡｣というのから推測して､別PCに差し替えたのなら､そのPCのｺﾝﾄﾛｰﾗの不具合とかｹｰﾌﾞﾙの品質とか接触とか電源とか､HDD以外の問題の可能性もあって､その場合､元PCに戻すとすんなり読めたりするかもしれません｡すんなりではなくてもﾁｪｯｸﾃﾞｨｽｸやﾃﾞｰﾀ復旧ｿﾌﾄで何日もかからず読めるようになったりするかもしれません｡
もしくはHDDが壊れているﾊﾟﾀｰﾝで､この場合ﾃﾞｰﾀ復旧ｻｰﾋﾞｽとかｿﾌﾄとか､またはこのままﾁｪｯｸﾃﾞｨｽｸが終わるまで待つかすると､無事な部分のﾌｧｲﾙが読めるようになったり､もしくはまったく読めなかったりします｡

原因が特定出来ればいいのですが､なかなか分かるものではないし､ちょっとしたことですんなり復旧する事もあるし､何やってもﾀﾞﾒなこともあるし……
ある程度は運だと思ってください｡