No.1
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クライアントとは全クライアントですよね？
クライアントにインストールさせているアプリケーションが時間をずらすことはよくありますがどうですか？
ネットワーク環境がよくわからないので適切なアドバイスができませんがMSの公式サイトにトラブルシューティングがあります。
No.2
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27pt
Active Directory 環境での時刻同期のための階層構造
ActiveDirectory環境ではクライアントは自動的に上位のサーバーと時刻同期されるように
設定されるので通常そのようなことは起きません。
クライアント側で別の時刻同期ソフトが動作していることは考えられないでしょうか？
> 通常そのようなことは起きません。
そうですよね。私もそう思います。
> クライアント側で別の時刻同期ソフトが動作していることは考えられないでしょうか？
やはりこの線が一番怪しそうですね。調べてみます。
No.3
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b-windさんの書かれている通り、ADでは基本的にドメインコントローラーと自動的に時刻同期がされます。
念のため、クライアントが参照しにいくドメインコントローラーが複数有るようであれば、それらの時刻にずれが無いかは確認してもらってもよいかと思います。
また、クライアント側のマザーボードのバッテリーが切れていると、再起動などのタイミングで時間がずれてしまう事はあるので、使用年数が高いPCであれば確認した方がいいかもしれません（その場合、もっと大きく時間がずれると思うので可能性は低いと思いますが）
ありがとうございます。
どうやら社内システムのサーバの１つ（ドメイン外）がずれていて、その時刻に合わせてしまっている可能性が高そうです。
調査してみますので、一旦閉めます。みなさんありがとうございました。
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ありがとうございます。
全クライアントを見張るわけにもいかないので確認は出来ていませんが、社内で満遍なく発生しています。
クライアントアプリの線は興味深いので調べて見ます。
MSのTSはAD環境とは別のようですね。